Le mot programmation vient du mot programme. Il s’agit de répartir le contenu des programmes dans les trois années du cycle et plus particulièrement  dans une année. Elle se préoccupe de la distribution chronologique des modules (ou séquences) retenues dans le cadre de la progression et prend en compte le calendrier scolaire. Il est essentiel que des séquences ne soient pas coupées par des vacances.

La programmation ne peut s’établir qu’en fonction de la classe et de ses spécificités.